Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Apol7aB2RT54 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Apol7aB2RT54 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apol7aB2RT54 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms