Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Phf3B2RQG2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Phf3B2RQG2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms