Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Grik3B1AS29 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Grik3B1AS29 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Grik3B1AS29 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms