Protein–RNA interactions for Protein: A7XV04

Skint7, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint7A7XV04 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Skint7A7XV04 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Skint7A7XV04 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Skint7A7XV04 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms