Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms