Protein–RNA interactions for Protein: A3KMP2

Ttc38, Tetratricopeptide repeat protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc38A3KMP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc38A3KMP2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc38A3KMP2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc38A3KMP2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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