Protein–RNA interactions for Protein: A2J008

Trgv2, MCG146472 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trgv2A2J008 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trgv2A2J008 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trgv2A2J008 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trgv2A2J008 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms