Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pramef17A2ASJ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pramef17A2ASJ1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pramef17A2ASJ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pramef17A2ASJ1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms