Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tubb1A2AQ07 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb1A2AQ07 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb1A2AQ07 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms