Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syndig1A2ANU3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syndig1A2ANU3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syndig1A2ANU3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms