Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn34c4A2ANA3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn34c4A2ANA3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms