Protein–RNA interactions for Protein: A2ALU4

Shroom2, Protein Shroom2, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom2A2ALU4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Shroom2A2ALU4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Shroom2A2ALU4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Shroom2A2ALU4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
Shroom2A2ALU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms