Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pramel3A2AHA7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Pramel3A2AHA7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pramel3A2AHA7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms