Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ambra1A2AH22 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ambra1A2AH22 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ambra1A2AH22 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms