Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Frmpd4A2AFR3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Frmpd4A2AFR3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Frmpd4A2AFR3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms