Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930447F04RikA2AFR2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930447F04RikA2AFR2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms