Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl2A2AFH2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl2A2AFH2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl2A2AFH2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl2A2AFH2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl2A2AFH2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ube2dnl2A2AFH2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ube2dnl2A2AFH2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2dnl2A2AFH2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms