Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cyb561d1A2AE42 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyb561d1A2AE42 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms