Protein–RNA interactions for Protein: A2A9H6

Gm884, Predicted gene 884, mousemouse

Predictions only

Length 3,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm884A2A9H6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm884A2A9H6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm884A2A9H6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm884A2A9H6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms