Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cul4bA2A432 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cul4bA2A432 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cul4bA2A432 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cul4bA2A432 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms