Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc112A0AUP1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc112A0AUP1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc112A0AUP1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms