Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
A0A0U1RNP2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
A0A0U1RNP2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
A0A0U1RNP2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A0A0U1RNP2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms