Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm5082-203ENSMUST00000221920 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 4930533L02Rik-201ENSMUST00000194425 1160 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 Olfr1076-201ENSMUST00000076263 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Speer3W4VSP1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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