Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Hdac6Q9Z2V5 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdac6Q9Z2V5 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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