Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ubl3Q9Z2M6 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms