Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Nek3Q9R0A5 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms