Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Rnf4Q9QZS2 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rnf4Q9QZS2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.5 ms