Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Col4a3Q9QZS0 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Col4a3Q9QZS0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms