Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Trappc2lQ9JME7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms