Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cabp1Q9JLK7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cabp1Q9JLK7 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms