Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tlr5Q9JLF7 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms