Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gde1Q9JL56 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gde1Q9JL56 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms