Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ybx3Q9JKB3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm5267-201ENSMUST00000191574 1045 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 AC122860.1-201ENSMUST00000217669 773 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ybx3Q9JKB3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms