Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim54Q9ERP3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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