Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
MesdQ9ERE7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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