Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

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Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Tlr1Q9EPQ1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Tlr1Q9EPQ1 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms