Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Syde1Q9DBZ9 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms