Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf6Q9DBU5 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf6Q9DBU5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf6Q9DBU5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rnf6Q9DBU5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms