Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Smdt1Q9DB10 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms