Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms