Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Alkbh4Q9D8F1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms