Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Rep15Q9D7T1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rep15Q9D7T1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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