Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Chmp4cQ9D7F7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chmp4cQ9D7F7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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