Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ttc9bQ9D6E4 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ttc9bQ9D6E4 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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