Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ccdc130Q9D516 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc130Q9D516 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc130Q9D516 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc130Q9D516 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ccdc130Q9D516 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms