Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Snx20Q9D2Y5 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms