Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pramef12Q9D2F1 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.1 ms