Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms