Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shmt2Q9CZN7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Shmt2Q9CZN7 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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