Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Shisa9Q9CZN4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Shisa9Q9CZN4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 524.9 ms